RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625215.2

PCBP1-AS1-272, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 844 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GPNMBQ14956 572 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ECM1Q16610 540 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 HYIQ5T013 277 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 RASIP1Q5U651 963 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZNF410Q86VK4 478 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 VWCEQ96DN2 955 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SLC9A7Q96T83 725 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 E9PMD0 336 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ASAP2O43150 1006 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GPR32O75388 356 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CD52P31358 61 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TFDP1Q14186 410 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 AGERQ15109 404 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TMEM143Q96AN5 459 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 NLRP4Q96MN2 994 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CSRNP2Q9H175 543 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TRIP11Q15643 1979 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 COL4A6Q14031 1691 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 A0A087WWV3 80 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GPR182O15218 404 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CUTAO60888 179 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 AMHP03971 560 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PHKA2P46019 1235 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 GRB10Q13322 594 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 FAM228AQ86W67 206 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CLIC6Q96NY7 704 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PNMA5Q96PV4 448 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TIPINQ9BVW5 301 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 KCND2Q9NZV8 630 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PADI3Q9ULW8 664 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 A0A087WZ62 844 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PLA2G4BP0C869 781 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CYP11B2P19099 503 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PLCG1P19174 1290 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 DDIT3P35638 169 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ARL2P36404 184 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 ME1P48163 572 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 PPP2R5AQ15172 486 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 RAB30Q15771 203 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 TCTN1Q2MV58 587 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 SPECC1Q5M775 1068 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-272ENST00000625215 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms