RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 SKIP12755 728 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 YWHABP31946 246 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 RFC5P40937 340 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 ITIH3Q06033 890 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 NR5A1Q13285 461 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 PTPN14Q15678 1187 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 CES5AQ6NT32 575 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB33Q86T24 672 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 C4orf19Q8IY42 314 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 TNFRSF25Q93038 417 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 DYDC2Q96IM9 177 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 IRAK3Q9Y616 596 aa13.53□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
CTIF-208ENST00000590422 WNT7AO00755 349 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TBX3O15119 743 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 BRD1O95696 1058 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ASGR2P07307 311 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 FDPSP14324 419 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 EPHA7Q15375 998 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.52□□□□□ -0.25
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CTIF-208ENST00000590422 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 FERMT3Q86UX7 667 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 RNF149Q8NC42 400 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 RSAD1Q9HA92 442 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 NR2E1Q9Y466 385 aa13.52□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN1O60635 241 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 POMCP01189 267 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MTHFRP42898 656 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 AK2P54819 239 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 PTPN5P54829 565 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 XKR9Q5GH70 373 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 NECAB1Q8N987 351 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 URGCPQ8TCY9 931 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 PGBD4Q96DM1 585 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MARCH5Q9NX47 278 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 HES2Q9Y543 173 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 PPME1Q9Y570 386 aa13.51□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CFAP54Q96N23 3096 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 F8W810 466 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 XBP1P17861 261 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 AVPR2P30518 371 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MTMR3Q13615 1198 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CABP7Q86V35 215 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TPH2Q8IWU9 490 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CPB2Q96IY4 423 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MTRQ99707 1265 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 RNF39Q9H2S5 420 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 IPPQ9Y573 584 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 NRP1O14786 923 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MARCH6O60337 910 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 LILRB3O75022 631 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ERLIN2O94905 339 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 SLITRK3O94933 977 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 KRT2P35908 639 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 MLH1P40692 756 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CLCN4P51793 760 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 FOSBP53539 338 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 PTENP60484 403 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 CAPSQ13938 189 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 GIT2Q14161 759 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 AMHR2Q16671 573 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ME3Q16798 604 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 TCP11Q8WWU5 503 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 ZFP42Q96MM3 310 aa13.49□□□□□ -0.25
CTIF-208ENST00000590422 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.49□□□□□ -0.25
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