RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 RGL1Q9NZL6 768 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 WEE2P0C1S8 567 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.62■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 TCP11Q8WWU5 503 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 RSAD1Q9HA92 442 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.61■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 FAM205CA6NFA0 338 aa21.61■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 CTDNEP1O95476 244 aa21.61■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.61■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 DYDC2Q96IM9 177 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 PHOX2BQ99453 314 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAF4-216ENST00000586813 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 USP34Q70CQ2 3546 aa21.59■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.59■■□□□ 1.05
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TRAF4-216ENST00000586813 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 USTQ9Y2C2 406 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 NRP1O14786 923 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 ASGR2P07307 311 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 ITGA4P13612 1032 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 AXLP30530 894 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 CLCN4P51793 760 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 ANAPC15P60006 121 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 PTENP60484 403 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAF4-216ENST00000586813 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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