RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GPS1-223	ENST00000584229		H0YCG3	227 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TLL1	O43897	1013 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	GAP43	P17677	238 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	AXL	P30530	894 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PAGE5	Q96GU1	130 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	USP20	Q9Y2K6	914 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NCKAP1L	P55160	1127 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	AMHR2	Q16671	573 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	BICD1	Q96G01	975 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FZD8	Q9H461	694 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	CUL4B	Q13620	913 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TOP1MT	Q969P6	601 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	YME1L1	Q96TA2	773 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.43	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229		C9IYK1	514 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ACKR2	O00590	384 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	GJB5	O95377	273 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	COASY	Q13057	564 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FAM187B	Q17R55	369 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.42	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	N4BP3	O15049	544 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	GCNT3	O95395	438 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NPTXR	O95502	500 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	EDN1	P05305	212 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PBX2	P40425	430 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	RAB27A	P51159	221 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2H	P62256	183 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	RAB30	Q15771	203 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC51	Q96ER9	411 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PBX4	Q9BYU1	374 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SKI	P12755	728 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MYOG	P15173	224 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	APOL6	Q9BWW8	343 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0U1RQF3	1178 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NR1I2	O75469	434 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PRR29	P0C7W0	189 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJB2	P25686	324 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	KANK3	Q6NY19	840 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	UNC13D	Q70J99	1090 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.39	■■□□□ 1.98
GPS1-223	ENST00000584229	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.38	■■□□□ 1.97

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