RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579716.2

COPS3-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-216ENST00000579716 TNNT1P13805 278 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ZNF24P17028 368 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GTF2H3Q13889 308 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SCARB2Q14108 478 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TERF2Q15554 542 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GEN1Q17RS7 908 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GNPTABQ3T906 1256 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NLRP10Q86W26 655 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SPERTQ8NA61 448 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 STON2Q8WXE9 905 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CHFRQ96EP1 664 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 BICD1Q96G01 975 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 FSD1Q9BTV5 496 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CRB3Q9BUF7 120 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 BRD9Q9H8M2 597 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NCANO14594 1321 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 EYA2O00167 538 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 PRRG2O14669 202 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GABRDO14764 452 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SLC7A4O43246 635 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 BRINP1O60477 761 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NMT2O60551 498 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ERLIN1O75477 346 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 PALMO75781 387 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 AKR1B1P15121 316 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CYP2C19P33261 490 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 S100A5P33763 92 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 HNF4AP41235 474 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CDC16Q13042 620 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 COG2Q14746 738 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 POSTNQ15063 836 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NKG7Q16617 165 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NRBF2Q96F24 287 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TTPALQ9BTX7 342 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 CBX8Q9HC52 389 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GPR34Q9UPC5 381 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TNKSO95271 1327 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 TRIM75PA6NK02 468 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GIPC1O14908 333 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 GPR39O43194 453 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 DAB1O75553 588 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 DGKIO75912 1065 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 FBXO21O94952 628 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 HSPA4LO95757 839 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 NPTX2P47972 431 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SLC12A2P55011 1212 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 BTKQ06187 659 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS3-216ENST00000579716 SPARCL1Q14515 664 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms