RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	CFB	P00751	764 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LGALS2	P05162	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJB1	P25685	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CTNNB1	P35222	781 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HSD17B4	P51659	736 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TCF15	Q12870	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CAMK1	Q14012	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ALX1	Q15699	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	STXBP2	Q15833	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		B4E1Z4	1266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		J3QW42	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MMP1	P03956	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GHR	P10912	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GATM	P50440	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAM17	P78536	824 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GHRHR	Q02643	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MGAT3	Q09327	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PGM5	Q15124	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SEPT8	Q92599	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MDFI	Q99750	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IL25	Q9H293	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EVPL	Q92817	2033 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF292	O60281	2723 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		B4DLN1	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		M0R296	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	STXBP3	O00186	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GIPC1	O14908	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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