RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SMIM22	K7EJ46	135 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	AGRP	O00253	132 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	NUAK1	O60285	661 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	IL1R1	P14778	569 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNJ6	P48051	423 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CDR1	P51861	262 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	PRR5	P85299	388 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MOGS	Q13724	837 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB33A	Q14088	237 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	IQCE	Q6IPM2	695 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MTA3	Q9BTC8	594 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNH6	Q9H252	994 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KCTD3	Q9Y597	815 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SCN9A	Q15858	1988 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	FUCA1	P04066	466 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	GLI4	P10075	376 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	NCKAP1L	P55160	1127 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CTSW	P56202	376 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	INF2	Q27J81	1249 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MBLAC2	Q68D91	279 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CABP7	Q86V35	215 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	BAD	Q92934	168 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	TIFA	Q96CG3	184 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	GJD2	Q9UKL4	321 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	AOX1	Q06278	1338 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	EYS	Q5T1H1	3165 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	NUP98	P52948	1817 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ARNTL	O00327	626 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CP	P00450	1065 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SCG5	P05408	212 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KLRK1	P26718	216 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	SSPN	Q14714	243 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	NFE2L2	Q16236	605 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	PANK1	Q8TE04	598 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		7.4	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PQU0	124 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	MSC	O60682	206 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	GRIA2	P42262	883 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	PPP2R2A	P63151	447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	NHLH1	Q02575	133 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	TRIB2	Q92519	343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	DIO2	Q92813	273 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	GREM2	Q9H772	168 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		7.39	□□□□□ -1.23

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