RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520712.1

CLVS1-206, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-206ENST00000520712 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TEKT5Q96M29 485 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 BDH2Q9BUT1 245 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 AMNQ9BXJ7 453 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 OR10A5Q9H207 317 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZMAT4Q9H898 229 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 JADE2Q9NQC1 790 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MPIG6BO95866 241 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MYBP10242 640 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 OSMP13725 252 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CD40P25942 277 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MC4RP32245 332 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 GPR3P46089 330 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 IL13RA1P78552 427 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PICALMQ13492 652 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 GTF2H3Q13889 308 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PDCD1Q15116 288 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 USP25Q9UHP3 1055 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MSRAQ9UJ68 235 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TRIM75PA6NK02 468 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 RASSF10A6NK89 507 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 K7ESM1 405 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ERC2O15083 957 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 AP1G1O43747 822 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TRIM27P14373 513 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 HSPA6P17066 643 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 VCAM1P19320 739 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CSF2RBP32927 897 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 EPHB4P54760 987 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 KRT85P78386 507 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CD83Q01151 205 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ADCY1Q08828 1119 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CCDC184Q52MB2 194 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TOR2AQ5JU69 321 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SLFN13Q68D06 897 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SVIPQ8NHG7 77 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 JADE3Q92613 823 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 AIFM3Q96NN9 605 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SARGQ9BW04 601 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ANO3Q9BYT9 981 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 EDARQ9UNE0 448 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 A0A0G2JNJ9 132 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 OFD1O75665 1012 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 APOL3O95236 402 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 BDNFP23560 247 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ETV4P43268 484 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 ROM1Q03395 351 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MAP3K12Q12852 859 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 MOGSQ13724 837 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 GBX1Q14549 363 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 SPATS1Q496A3 300 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 GPR158Q5T848 1215 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-206ENST00000520712 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms