RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 A6NNZ2 444 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PPFIA2O75334 1257 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CYP3A4P08684 503 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 COMTP21964 271 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 IFNAR2P48551 515 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PMS2P54278 862 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NPEPPSP55786 919 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC29A2Q14542 456 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PRELID2Q8N945 189 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 IL31RAQ8NI17 732 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DMAC2Q9NW81 257 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 RPTORQ8N122 1335 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CHN1P15882 459 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC5A5Q92911 643 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 IDI2Q9BXS1 227 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.2■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ANKRD62A6NC57 917 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC26A4O43511 780 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NPR1P16066 1061 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC114Q96M63 670 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 RAB17Q9H0T7 212 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MMP10P09238 476 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 POLR2MP0CAP2 368 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PYGMP11217 842 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PPP2R5CQ13362 524 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DGKZQ13574 1117 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CEP55Q53EZ4 464 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CARD9Q9H257 536 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 GGT7Q9UJ14 662 aa15.19■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CYP26A1O43174 497 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CLSTN1O94985 981 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DRD4P21917 467 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PTGIRP43119 386 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 KIF22Q14807 665 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 EPC2Q52LR7 807 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 C2CD6Q53TS8 623 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PADI6Q6TGC4 694 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TATDN2Q93075 761 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TLCD1Q96CP7 247 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MMEP08473 750 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ANXA13P27216 316 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF131P52739 623 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SNX1Q13596 522 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DENND2CQ68D51 928 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 GPATCH11Q8N954 259 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NEK9Q8TD19 979 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MGARPQ8TDB4 240 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SAAL1Q96ER3 474 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 NACC1Q96RE7 527 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.18■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CHRNB2P17787 502 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ITGB5P18084 799 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 CHRNA5P30532 468 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 VAMP7P51809 220 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 SLC15A2Q16348 729 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.17■□□□□ 0.02
CNGA3-204ENST00000409937 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 202 ms