RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PODXLO00592 558 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FECHP22830 423 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 STX2P32856 288 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NPY5RQ15761 445 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 USP38Q8NB14 1042 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 HGSO14964 777 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ACTN1P12814 892 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SLC9A1P19634 815 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 AKT3Q9Y243 479 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 A0A087X0T9 212 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 LRRIQ4A6NIV6 560 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FAM228BP0C875 321 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CARSP49589 748 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PTK2Q05397 1052 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GLYCTKQ8IVS8 523 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 BBOF1Q8ND07 529 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM11Q96F44 468 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MTMR9Q96QG7 549 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 VGLL3A8MV65 326 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PJA2O43164 708 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 GNAT1P11488 350 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM60Q495X7 471 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 LRIG3Q6UXM1 1119 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM50Q86XT4 487 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM59Q8IWR1 403 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 STK33Q9BYT3 514 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SIK3Q9Y2K2 1263 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 FAM187AA6NFU0 413 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ECEL1O95672 775 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ZIM3Q96PE6 472 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 APOL6Q9BWW8 343 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 PIDD1Q9HB75 910 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 POLD4Q9HCU8 107 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 INTUQ9ULD6 942 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 POLIQ9UNA4 740 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRG-201ENST00000295874 MYO1FO00160 1098 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R37O75864 691 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SPDL1Q96EA4 605 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM4Q9C037 500 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PFASO15067 1338 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 F8W8V4 182 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GPC4O75487 556 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFB10O96000 172 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY8P40145 1251 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GPC5P78333 572 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EVX2Q03828 476 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MIIPQ5JXC2 388 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 BANK1Q8NDB2 785 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GIMAP4Q9NUV9 329 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RGL1Q9NZL6 768 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 USTQ9Y2C2 406 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PADI6Q6TGC4 694 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC31Q6UY01 552 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RAET1EQ8TD07 263 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC138Q96M89 665 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 AFF2P51816 1311 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MYBP10242 640 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 VPS41P49754 854 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY2Q08462 1091 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EPHA7Q15375 998 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 C6orf118Q5T5N4 469 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EHD2Q9NZN4 543 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM66O15016 1216 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.1 ms