RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	B4galnt4	Q766D5	1034 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Snupn	Q80W37	358 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Olfml2a	Q8BHP7	681 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nol11	Q8BJW5	723 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mical2	Q8BML1	960 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrp11	Q8CB67	483 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Spata2	Q8K004	515 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Optn	Q8K3K8	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Olfr1440	Q8VFV4	315 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kcnh5	Q920E3	988 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lce1b	Q9D149	137 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sp2	Q9D2H6	612 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Itpa	Q9D892	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aldh6a1	Q9EQ20	535 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lmbr1	Q9JIT0	490 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Plag1	Q9QYE0	499 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sema4g	Q9WUH7	837 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rps6ka4	Q9Z2B9	773 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pappa2	E9PZ87	1789 aa		5.09	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Map3k19	E9Q3S4	1311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Elp1	Q7TT37	1333 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Agmat	A2AS89	358 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Acbd4	E9Q289	327 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	2010300C02Rik	E9Q3M9	1175 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm11237	F2Z3W5	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm11238	F2Z478	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm11236	J3QMS7	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atp2a2	O55143	1044 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Egr1	P08046	533 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hmgb2	P30681	210 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tle3	Q08122	772 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lgr6	Q3UVD5	967 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prpf38a	Q4FK66	312 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Uimc1	Q5U5Q9	727 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Scn4b	Q7M729	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zswim5	Q80TC6	1188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ercc6l	Q8BHK9	1240 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Brf1	Q8CFK2	676 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Scara5	Q8K299	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Clrn1	Q8K445	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Arl13a	Q9D416	372 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pgd	Q9DCD0	483 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cdk12	Q14AX6	1484 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nphp4	P59240	1425 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Flt4	P35917	1363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tnks	Q6PFX9	1320 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sycp2l	A0A0M3U1B0	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm42957	D6RFQ2	366 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccdc175	E9PVB3	822 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Reps1	O54916	795 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Srpk1	O70551	648 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tp53	P02340	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nudt10	P0C027	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nudt11	P0C028	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nedd4	P46935	887 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slitrk6	Q8C110	840 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sltm	Q8CH25	1031 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nup133	Q8R0G9	1155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cpa5	Q8R4H4	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Wnt9a	Q8R5M2	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Actl6b	Q99MR0	426 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fancl	Q9CR14	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Noxred1	Q9D3S5	366 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Acss2	Q9QXG4	701 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Casr	Q9QY96	1079 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Plp2	Q9R1Q7	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Col6a3	E9PWQ3	3284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Znf335	A2A5K6	1337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cobl	Q5NBX1	1337 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	D930048N14Rik	A2AA67	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Plekhd1	B2RPU2	505 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Muc3	E9PWP7	378 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ythdc1	E9Q5K9	736 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klrk1	O54709	232 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gli1	P47806	1111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc1a5	P51912	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dlx4	P70436	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nfe2	Q07279	373 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Afap1l2	Q5DTU0	825 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Phc1	Q64028	1012 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	B4galnt3	Q6L8S8	986 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rnf220	Q6PDX6	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kdm1a	Q6ZQ88	853 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dirc2	Q8BFQ6	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Idi2	Q8BFZ6	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prpf18	Q8BM39	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc15a5	Q8CBB2	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccdc150	Q8CDI7	1110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Phldb2	Q8K1N2	1249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prkd3	Q8K1Y2	889 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rbm19	Q8R3C6	952 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mlc1	Q8VHK5	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klc3	Q91W40	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q91WD4	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klhdc4	Q921I2	584 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nlgn1	Q99K10	843 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rnf135	Q9CWS1	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Emc9	Q9DB76	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nacc2	Q9DCM7	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pik3ap1	Q9EQ32	811 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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