Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Lrp11Q8CB67 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrp11Q8CB67 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lrp11Q8CB67 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrp11Q8CB67 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrp11Q8CB67 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrp11Q8CB67 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Lrp11Q8CB67 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrp11Q8CB67 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lrp11Q8CB67 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrp11Q8CB67 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrp11Q8CB67 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lrp11Q8CB67 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Lrp11Q8CB67 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrp11Q8CB67 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lrp11Q8CB67 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrp11Q8CB67 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrp11Q8CB67 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lrp11Q8CB67 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrp11Q8CB67 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrp11Q8CB67 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrp11Q8CB67 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrp11Q8CB67 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrp11Q8CB67 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrp11Q8CB67 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrp11Q8CB67 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrp11Q8CB67 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrp11Q8CB67 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrp11Q8CB67 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrp11Q8CB67 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrp11Q8CB67 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrp11Q8CB67 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrp11Q8CB67 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrp11Q8CB67 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrp11Q8CB67 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrp11Q8CB67 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrp11Q8CB67 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp11Q8CB67 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrp11Q8CB67 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrp11Q8CB67 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrp11Q8CB67 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrp11Q8CB67 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrp11Q8CB67 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrp11Q8CB67 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrp11Q8CB67 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrp11Q8CB67 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrp11Q8CB67 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrp11Q8CB67 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp11Q8CB67 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrp11Q8CB67 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrp11Q8CB67 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrp11Q8CB67 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrp11Q8CB67 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrp11Q8CB67 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrp11Q8CB67 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrp11Q8CB67 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrp11Q8CB67 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrp11Q8CB67 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrp11Q8CB67 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrp11Q8CB67 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrp11Q8CB67 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrp11Q8CB67 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrp11Q8CB67 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrp11Q8CB67 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrp11Q8CB67 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrp11Q8CB67 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrp11Q8CB67 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrp11Q8CB67 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrp11Q8CB67 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrp11Q8CB67 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrp11Q8CB67 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrp11Q8CB67 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrp11Q8CB67 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrp11Q8CB67 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp11Q8CB67 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp11Q8CB67 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp11Q8CB67 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrp11Q8CB67 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp11Q8CB67 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrp11Q8CB67 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp11Q8CB67 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrp11Q8CB67 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrp11Q8CB67 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrp11Q8CB67 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrp11Q8CB67 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrp11Q8CB67 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrp11Q8CB67 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrp11Q8CB67 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrp11Q8CB67 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrp11Q8CB67 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrp11Q8CB67 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrp11Q8CB67 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrp11Q8CB67 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrp11Q8CB67 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp11Q8CB67 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
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