RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049908.10

Ssbp4-201, Transcript of Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ssbp4, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Msantd2Q6NZR2 559 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Apol10aQ8CCA5 318 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tceal5Q8CCT4 200 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pstpip2Q99M15 334 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pramel1Q99MW3 458 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 CenpsQ9D084 142 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Piezo1E2JF22 2547 aa22.95■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Col4a6B1AVK5 1691 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ace3D0G895 737 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 CcnoP0C242 352 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Arf4P61750 180 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Fgfr4Q03142 799 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Nat8lQ3UGX3 299 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rsad1Q5SUV1 442 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cd180Q62192 661 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Enpp3Q6DYE8 874 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr1046Q7TR79 316 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Fbxl5Q8C2S5 690 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Capns2Q9D7J7 247 aa22.94■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gm7168A0AUV4 508 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cdc27A2A6Q5 825 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gm9992B2RWK3 458 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Unc93aQ710D3 458 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rexo1Q7TT28 1213 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 HomezQ80W88 542 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tor4aQ8BH02 426 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tmem117Q8BH18 514 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rpap2Q8VC34 614 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Atg13Q91YI1 516 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Bbox1Q924Y0 387 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Git2Q9JLQ2 708 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Prl2c5Q9JLV9 222 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 CtsfQ9R013 462 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Hebp1Q9R257 190 aa22.93■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Orc4O88708 433 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 EpoP07321 192 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cyp11b2P15539 500 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Prss36Q5K2P8 849 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 KyQ8C8H8 661 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pls3Q99K51 630 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 TheglQ9DA15 459 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 EgfP01132 1217 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kif4P33174 1231 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 PrkcbP68404 671 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 ArvcfP98203 962 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Slc26a2Q62273 739 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cep135Q6P5D4 1140 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Mrgprb8Q7TN51 330 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Dnajc28Q8VCE1 385 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 MbipQ99LQ1 341 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 PpihQ9D868 188 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 B4galt5Q9JMK0 388 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.92■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Zfp984A2A7A2 547 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Bpifb4A2BGH0 617 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Hcn4O70507 1186 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 P01734 135 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Sdc2P43407 202 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Smpd1Q04519 627 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Slc7a1Q09143 622 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Upf3aQ3ULJ3 422 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Krt14Q61781 484 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ttc39bQ8BYY4 617 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Abi1Q8CBW3 481 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Enox2Q8R0Z2 598 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ushbp1Q8R370 680 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Acot11Q8VHQ9 594 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tbx18Q9EPZ6 613 aa22.91■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pex10B1AUE5 324 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Apol10bG3X9K7 334 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cxcl12P40224 93 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Epb41l4aP52963 686 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 GmipQ6PGG2 971 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Naa35Q6PHQ8 725 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Map3k11Q80XI6 850 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr1352Q8VGX5 309 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Myl7Q9QVP4 175 aa22.9■■□□□ 1.26
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 ThadaA8C756 1938 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Mdm4O35618 489 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 P4hbP09103 509 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kcnj6P48542 425 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cd163Q2VLH6 1121 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ctnna3Q65CL1 895 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Txndc16Q7TN22 820 aa22.89■■□□□ 1.25
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Dzip3Q7TPV2 1204 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.8 ms