Protein–RNA interactions for Protein: P01132

Egf, Pro-epidermal growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfP01132 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,6■■■■■ 4,25
EgfP01132 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
EgfP01132 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
EgfP01132 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
EgfP01132 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
EgfP01132 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
EgfP01132 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
EgfP01132 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
EgfP01132 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
EgfP01132 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
EgfP01132 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
EgfP01132 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,72■■■■□ 3,15
EgfP01132 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
EgfP01132 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
EgfP01132 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
EgfP01132 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
EgfP01132 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,7■■■□□ 2,98
EgfP01132 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
EgfP01132 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
EgfP01132 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,56■■■□□ 2,96
EgfP01132 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
EgfP01132 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,39■■■□□ 2,94
EgfP01132 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
EgfP01132 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
EgfP01132 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
EgfP01132 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
EgfP01132 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
EgfP01132 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
EgfP01132 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
EgfP01132 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
EgfP01132 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
EgfP01132 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
EgfP01132 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
EgfP01132 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
EgfP01132 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,78■■■□□ 2,84
EgfP01132 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
EgfP01132 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
EgfP01132 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,37■■■□□ 2,77
EgfP01132 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,18■■■□□ 2,74
EgfP01132 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
EgfP01132 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
EgfP01132 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
EgfP01132 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,04■■■□□ 2,72
EgfP01132 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
EgfP01132 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
EgfP01132 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,88■■■□□ 2,69
EgfP01132 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
EgfP01132 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,8■■■□□ 2,68
EgfP01132 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
EgfP01132 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
EgfP01132 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
EgfP01132 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
EgfP01132 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
EgfP01132 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
EgfP01132 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
EgfP01132 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
EgfP01132 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
EgfP01132 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
EgfP01132 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
EgfP01132 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
EgfP01132 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
EgfP01132 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
EgfP01132 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
EgfP01132 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
EgfP01132 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
EgfP01132 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
EgfP01132 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
EgfP01132 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
EgfP01132 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
EgfP01132 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
EgfP01132 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
EgfP01132 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,93■■■□□ 2,54
EgfP01132 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
EgfP01132 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
EgfP01132 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
EgfP01132 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
EgfP01132 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
EgfP01132 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
EgfP01132 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
EgfP01132 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
EgfP01132 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
EgfP01132 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
EgfP01132 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
EgfP01132 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
EgfP01132 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
EgfP01132 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
EgfP01132 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
EgfP01132 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
EgfP01132 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
EgfP01132 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
EgfP01132 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
EgfP01132 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
EgfP01132 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
EgfP01132 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
EgfP01132 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
EgfP01132 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
EgfP01132 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
EgfP01132 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,44■■■□□ 2,46
EgfP01132 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,38■■■□□ 2,45
EgfP01132 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms