RNA–Protein interactions for RNA: YMR068W

AVO2, Transcript of Component of a complex containing the Tor2p kinase and other proteins, yeast

Gene AVO2, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO2	YMR068W	YHL037C	P38733	133 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	PCL7	P40186	285 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	YIL024C	P40543	189 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	RTS2	P40962	232 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	MNN5	P46982	586 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	STE24	P47154	453 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	BRO1	P48582	844 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	YDR387C	Q04162	555 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	GEP5	Q12393	293 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
AVO2	YMR068W	DBF2	P22204	572 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SUR1	P33300	382 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MDV1	P47025	714 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YIP5	P53108	310 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	VTI1	Q04338	217 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	BOP2	Q06150	570 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ICT1	Q12385	394 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.7	□□□□□ -1.5	not detected
AVO2	YMR068W	EXO70	P19658	623 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SPC34	P36131	295 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	FRT2	P39734	528 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	APQ12	P40532	138 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	TRS85	P46944	698 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SAM50	P53969	484 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	IZH1	Q03419	316 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MSS11	Q03825	758 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	GSH2	Q08220	491 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MDY2	Q12285	212 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ECM25	P32525	599 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	VPS17	P32913	551 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SMF2	P38778	549 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YFL051C	P43552	160 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	EFM3	P47163	339 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MDM34	P53083	459 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SPP2	Q02521	185 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MIX14	Q04341	121 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	IPK1	Q06667	281 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PRB1	P09232	635 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	HNM1	P19807	563 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YCL068C	P25593	260 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ARN2	P38724	620 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	FLO5	P38894	1075 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PAC11	P40960	533 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YFL012W	P43580	148 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ATX2	Q12067	313 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	STE2	D6VTK4	431 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PTR2	P32901	601 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YKL102C	P34249	101 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ECM15	P35195	104 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	REX4	Q08237	289 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	STE3	P06783	470 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SPO12	P17123	173 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RAD57	P25301	460 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	ACH1	P32316	526 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MRPS5	P33759	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PCL6	P40038	420 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PGU1	P47180	361 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PCP1	P53259	346 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	BSC1	Q12140	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	DAL80	P26343	269 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	RPB9	P27999	122 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	QDR3	P38227	689 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SEI1	Q06058	285 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	SFG1	Q12507	346 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AVO2	YMR068W	HEM4	P06174	275 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AVO2	YMR068W	SDH3	P33421	198 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AVO2	YMR068W	MSG5	P38590	489 aa		5.64	□□□□□ -1.51
AVO2	YMR068W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51

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