RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	KAP120	Q02932	1032 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	SMP3	Q04174	516 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	HEM4	P06174	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	ATG15	P25641	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	RPC82	P32349	654 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.82	□□□□□ -0.36	not detected
RRN5	YLR141W	RRG9	P40156	214 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	NAS2	P40555	220 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	MON1	P53129	644 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	ELP6	Q04868	273 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	RAF1	Q06891	181 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	MET2	P08465	486 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	RSM24	Q03976	319 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	AGE1	Q04412	482 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YDL180W	Q12301	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	TPK3	P05986	398 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	CHL4	P38907	458 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	SEN34	P39707	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	POP1	P41812	875 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	RRN9	P53437	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	COG5	P53951	403 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	HMS1	Q12398	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	MHF1	Q3E835	90 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YBR138C	P38277	524 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	MRPL19	P53875	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	OST6	Q03723	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YPR097W	Q06839	1073 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	FAR1	P21268	830 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	SWP82	P43554	623 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	HOT1	Q03213	719 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RRN5	YLR141W	SAM35	P14693	329 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	OAC1	P32332	324 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	ARN2	P38724	620 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MLH1	P38920	769 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MPH1	P40562	993 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SAM37	P50110	327 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MKC7	P53379	596 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MRP51	Q02950	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YMD8	Q03697	442 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MIM1	Q08176	113 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SIA1	Q12212	622 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SEC12	P11655	471 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YER184C	P39961	794 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	IDP2	P41939	412 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PCP1	P53259	346 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PPA2	P28239	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YBR285W	P38354	144 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YHL037C	P38733	133 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SSY5	P47002	699 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PGA1	P53896	198 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YDR102C	Q03864	110 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SPC19	Q03954	165 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	API2	Q04413	109 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YPQ2	Q06328	317 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	CTS2	Q06350	511 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MED2	Q12124	431 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PRB1	P09232	635 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PPG1	P32838	368 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	NUP116	Q02630	1113 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YAP6	Q03935	383 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YLR345W	Q06137	509 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MLC2	Q06580	163 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SPO7	P18410	259 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	GIT1	P25346	518 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	ZRG8	P40021	1076 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	BNA7	Q04066	261 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	TAZ1	Q06510	381 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	NFT1	P0CE68	1218 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SPS100	P13130	326 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PHO80	P20052	293 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YCL002C	P25565	263 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	COS10	P52924	374 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	OPI3	P05375	206 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	VPH2	P32341	215 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	YFL051C	P43552	160 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	SNZ1	Q03148	297 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RRN5	YLR141W	MRL1	Q06815	381 aa		12.71	□□□□□ -0.37

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