RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	YGL118C	P53132	145 aa		3.26	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	CAX4	P53223	239 aa		3.26	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	PRM4	Q12498	284 aa		3.26	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	GAL3	P13045	520 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	RPB9	P27999	122 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	YKL187C	P34231	750 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	CTM1	P38818	585 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	VTI1	Q04338	217 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	MIM1	Q08176	113 aa		3.25	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	RCK1	P38622	512 aa		3.24	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	SHE4	P51534	789 aa		3.24	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	PGC1	Q08959	321 aa		3.24	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	OPI1	P21957	404 aa		3.23	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	PET8	P38921	284 aa		3.23	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	SLM1	P40485	686 aa		3.23	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	IRC4	Q03036	179 aa		3.23	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	SRB2	P34162	210 aa		3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	RPN14	P53196	417 aa		3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	TFC7	Q12415	435 aa		3.22	□□□□□ -1.89
OMA1	YKR087C	YPS1	P32329	569 aa		3.21	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YNR066C	P53752	436 aa		3.21	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	INO2	P26798	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	ZRT1	P32804	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	BUD2	P33314	1104 aa		3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	END3	P39013	349 aa		3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	AIM20	P40451	204 aa		3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	STE23	Q06010	1027 aa		3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	TRM10	Q12400	293 aa		3.19	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YPR096C	O13587	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	SUR1	P33300	382 aa		3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	DIA1	P54005	336 aa		3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	SNX41	Q04053	625 aa		3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	UBX2	Q04228	584 aa		3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	SPO73	P40031	143 aa		3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	CAB5	Q03941	241 aa		3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	VIK1	Q12045	647 aa		3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YPR1	Q12458	312 aa		3.17	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YKL162C	P36052	402 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YHR035W	P38769	630 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YFL040W	P43562	540 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	YPL264C	Q08980	353 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	ERP3	Q12403	225 aa		3.16	□□□□□ -1.9
OMA1	YKR087C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ECM14	P38836	430 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	INA22	P40576	216 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YJL144W	P47009	104 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YGR266W	P53326	701 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YPR063C	Q12160	140 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	IES3	Q12345	250 aa		3.15	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	DAL5	P15365	543 aa		3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	SWC5	P38326	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	FET3	P38993	636 aa		3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	GTO3	Q04806	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	LAG2	Q92325	660 aa		3.14	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
OMA1	YKR087C	STF1	P01098	86 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	MRPL6	P32904	214 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	CSE1	P33307	960 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	SSO2	P39926	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	OKP1	P53298	406 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	CSI1	Q04368	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	HRT1	Q08273	121 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ECO1	P43605	281 aa		3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	IGO1	P53897	168 aa		3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	VPS20	Q04272	221 aa		3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	DXO1	Q06349	442 aa		3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
OMA1	YKR087C	PET18	P25362	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms