RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN3	YKL125W	MDM31	P38880	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	HPA3	P39979	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	VMA21	P41806	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	GAT1	P43574	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PFD1	P46988	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YGR151C	P53287	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	DIA1	P54005	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	VPS9	P54787	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ROD1	Q02805	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	MYO1	P08964	1928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	MAK31	P23059	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PET18	P25362	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ATG15	P25641	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	GAC1	P28006	793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	COS9	P36034	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PNT1	P38969	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YAR028W	P39548	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	COG3	P40094	801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	POG1	P40473	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	LCB2	P40970	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	IRC7	P43623	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YAR1	P46683	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	TAH11	P47112	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YJR124C	P47159	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PHO23	P50947	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ROG1	P53118	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	EOS1	P53938	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	RHO4	Q00246	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ATC1	Q04005	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	HRD1	Q08109	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	POM33	Q12164	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	RMD5	Q12508	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SUC2	P00724	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	NUP1	P20676	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	KIN82	P25341	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ELO2	P25358	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YCR061W	P25639	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SFC1	P33303	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SNC2	P33328	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	TGL1	P34163	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	CKB2	P38930	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PHO90	P39535	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	VPS52	P39904	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ELO3	P40319	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YNR061C	P53747	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YNL181W	P53878	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	NRK1	P53915	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	MET14	Q02196	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	NYV1	Q12255	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SUL2	Q12325	893 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	TFC7	Q12415	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	SGA1	P08019	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	UNG1	P12887	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	MKK2	P32491	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YEF1	P32622	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YBR096W	P38256	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ICS2	P38284	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YPC1	P38298	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	CHS7	P38843	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PFS1	P38872	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	BDH1	P39714	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PMT6	P42934	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	FLC3	P53121	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	GUP1	P53154	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YGR035C	P53222	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YGR079W	P53249	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YNL184C	P53876	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YDR366C	P87287	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	CYT2	Q00873	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	EKI1	Q03764	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	DUS4	Q06063	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	TPO4	Q12256	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ATG5	Q12380	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	ERP3	Q12403	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3	YKL125W	PRM4	Q12498	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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