RNA–Protein interactions for RNA: YHR036W

BRL1, Transcript of Essential nuclear envelope integral membrane protein, yeast

Gene BRL1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRL1	YHR036W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SEC17	P32602	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YPT7	P32939	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	AYR1	P40471	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YIL012W	P40551	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	STB1	P42845	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NAS6	P50086	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	INP1	Q03694	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SNX41	Q04053	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NAT4	Q04751	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	COX20	Q04935	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	FAR8	Q05040	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ULA1	Q12059	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RKI1	Q12189	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	POM34	Q12445	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	BPH1	P25356	2167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	UNG1	P12887	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CAF4	P36130	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ANS1	P38832	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YER188W	P40103	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	PMT6	P42934	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	STE23	Q06010	1027 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SPE4	Q12455	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TPK2	P06245	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TFS1	P14306	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPB9	P27999	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ITR1	P30605	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RIB7	P33312	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YHR218W	P38899	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SMK1	P41808	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YFL051C	P43552	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	URB2	P47108	1174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ILM1	P47155	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	EKI1	Q03764	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MGR3	Q04472	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NNT1	Q05874	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SFH1	Q06168	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CHK1	P38147	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	STP2	P38704	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	COG3	P40094	801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MRPL19	P53875	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SGT1	Q08446	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SAS5	Q99314	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MRE11	P32829	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YBR242W	P38331	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YHR177W	P38867	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YHR180W	P38868	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	FAA2	P39518	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YIL077C	P40508	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TAX4	P47030	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	PCP1	P53259	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	COS6	P53344	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MNT4	P53745	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DUG3	P53871	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	UGO1	Q03327	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RSN1	Q03516	953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DML1	Q03652	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	DCS1	Q06151	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SNF8	Q12483	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPO26	P20435	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ITR2	P30606	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	NPL6	P32832	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	RPC34	P32910	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	MOB2	P43563	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	YFR054C	P43622	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SNX4	P47057	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	ABM1	P47146	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRL1	YHR036W	SRB7	P47822	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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