RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589501.1

TYMSP2-201, Transcript of thymidylate synthetase pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TYMSP2, Length 424 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP2-201ENST00000589501 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TLR9Q9NR96 1032 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.9□□□□□ -0.02
TYMSP2-201ENST00000589501 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 FGF18O76093 207 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 BMP1P13497 986 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 GJB2P29033 226 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PRPHP41219 470 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 KCNQ1P51787 676 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PDIA5Q14554 519 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CASD1Q96PB1 797 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CLDND1Q9NY35 253 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 STK39Q9UEW8 545 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.89□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZNF623O75123 536 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PTENP60484 403 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PLCB3Q01970 1234 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 COL19A1Q14993 1142 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PPP2R5AQ15172 486 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 KRT79Q5XKE5 535 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 HELQQ8TDG4 1101 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CWH43Q9H720 699 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 SPG21Q9NZD8 308 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.88□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZBTB39O15060 712 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 MED24O75448 989 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CSPG5O95196 566 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PDCP20941 246 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ARL2P36404 184 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 NDUFV1P49821 464 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PTGDRQ13258 359 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CAPSQ13938 189 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 POTEGQ6S5H5 508 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 TMEM169Q96HH4 297 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 RSAD1Q9HA92 442 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.87□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 TRANK1O15050 2925 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 BMP15O95972 392 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 HYAL1Q12794 435 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PADI6Q6TGC4 694 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 EFHBQ8N7U6 833 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 IFT74Q96LB3 600 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 RNF19AQ9NV58 838 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.86□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 TSPAN1O60635 241 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 CYP11B2P19099 503 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 GLRA2P23416 452 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 NAMPTP43490 491 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 GIT2Q14161 759 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 BRAPQ7Z569 592 aa14.85□□□□□ -0.03
TYMSP2-201ENST00000589501 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms