RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRB-208ENST00000550358 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 GPRASP2Q96D09 838 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQJ5 194 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 PPP2R5CQ13362 524 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 TTC23LQ6PF05 361 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-208ENST00000550358 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.06□□□□□ -0.96
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