RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-215	ENST00000537304	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	WHRN	Q9P202	907 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LMO3-215	ENST00000537304	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PDXK	O00764	312 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	AP1G2	O75843	785 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ALAS1	P13196	640 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CTNNA2	P26232	953 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PTGIR	P43119	386 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	GALC	P54803	685 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	LRRC41	Q15345	812 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	MUM1	Q2TAK8	710 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.65	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	NR2F2	P24468	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	VHL	P40337	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	EPHA7	Q15375	998 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	MARCH6	O60337	910 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	VCAM1	P19320	739 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SOX5	P35711	763 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ADCY7	P51828	1080 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	DDB1	Q16531	1140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	MAGEB2	O15479	319 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CYTH3	O43739	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ECE2	O60344	883 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	PEX11A	O75192	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ECEL1	O95672	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	BRAF	P15056	766 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ITIH2	P19823	946 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	SLC18A1	P54219	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	GSTA3	Q16772	222 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LMO3-215	ENST00000537304	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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