RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	DLG4	P78352	724 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	OTUD5	Q96G74	571 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	NAGPA	Q9UK23	515 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	EMSY	Q7Z589	1322 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF185	O15231	689 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	GFPT2	O94808	682 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ATG7	O95352	703 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CBX1	P83916	185 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	FSTL1	Q12841	308 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	XKR3	Q5GH77	459 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	VPS36	Q86VN1	386 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PNKP	Q96T60	521 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	DENND3	A2RUS2	1198 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CXCL11	O14625	94 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP8B1	O43520	1251 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	EDNRB	P24530	442 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	GPR88	Q9GZN0	384 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	TSKS	Q9UJT2	592 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	EVI5	O60447	810 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	TUBB	P07437	444 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PPP3CA	Q08209	521 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CREG2	Q8IUH2	290 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CAGE1	Q8TC20	777 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CDCA5	Q96FF9	252 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	TLR10	Q9BXR5	811 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH10	P35580	1976 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PMM2	O15305	246 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SORBS3	O60504	671 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ADRB2	P07550	413 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ADSS	P30520	456 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	NF2	P35240	595 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SOX10	P56693	466 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CETN1	Q12798	172 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	EPC2	Q52LR7	807 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	KRT222	Q8N1A0	295 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CNMD	O75829	334 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CNGA1	P29973	690 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	COG1	Q8WTW3	980 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SYT17	Q9BSW7	474 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF302	Q9NR11	478 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	24.83	■■□□□ 1.57	3e-7	■■■■□ 19.9
PDE4D-223	ENST00000515011	PALM	O75781	387 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	ITIH3	Q06033	890 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SYT11	Q9BT88	431 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	INTU	Q9ULD6	942 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	USP20	Q9Y2K6	914 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
PDE4D-223	ENST00000515011	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		24.83	■■□□□ 1.56
PDE4D-223	ENST00000515011	NCK2	O43639	380 aa		24.83	■■□□□ 1.56
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC172	P0C7W6	258 aa		24.83	■■□□□ 1.56
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP4A	P20648	1035 aa		24.83	■■□□□ 1.56
PDE4D-223	ENST00000515011	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.56

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