RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PP2D1A8MPX8 630 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 STX6O43752 255 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 EYA4O95677 639 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC25AP30304 524 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 UBA7P41226 1012 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPSQ13938 189 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ECM1Q16610 540 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 KIFAP3Q92845 792 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 P2RX5Q93086 422 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A4O43511 780 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 NOTUMQ6P988 496 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC43Q8N309 656 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CNNM3Q8NE01 707 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CALML4Q96GE6 196 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 THEGQ9P2T0 379 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 E9PMD0 336 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF623O75123 536 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 LAG3P18627 525 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CABP7Q86V35 215 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 HACE1Q8IYU2 909 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 DEPTORQ8TB45 409 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC51Q96ER9 411 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CASD1Q96PB1 797 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 AAK1Q2M2I8 961 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 HELQQ8TDG4 1101 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 COG5Q9UP83 839 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-210ENST00000505941 CARNS1A5YM72 827 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPAN1O60635 241 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 NAMPTP43490 491 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 RESTQ13127 1097 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 URGCPQ8TCY9 931 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 DRC1Q96MC2 740 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR6Q9Y217 621 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00271P0C7V0 271 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 EFNA5P52803 228 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MAPK6Q16659 721 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 LONRF3Q496Y0 759 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 HYIQ5T013 277 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 HLA-CQ95604 372 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PLIN2Q99541 437 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 TIPINQ9BVW5 301 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM6O15303 877 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGA4P13612 1032 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT17Q04695 432 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE3AQ05086 875 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 LPPQ93052 612 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CPB2Q96IY4 423 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF558Q96NG5 402 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CSRNP2Q9H175 543 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CLIC4Q9Y696 253 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 TRANK1O15050 2925 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 NCK2O43639 380 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms