RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN1O60635 241 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 EOMESO95936 686 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 BMPR1AP36894 532 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 UBA7P41226 1012 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A14Q15043 492 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 AMHR2Q16671 573 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-211ENST00000480301 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ZNF623O75123 536 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PKP1Q13835 747 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 UBXN11Q5T124 520 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LRRC15Q8TF66 581 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 KIFAP3Q92845 792 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CLIC6Q96NY7 704 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CASD1Q96PB1 797 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CSRNP2Q9H175 543 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.2■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 H3BNC9 293 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 HOXA2O43364 376 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ERLIN2O94905 339 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 F13A1P00488 732 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A3P55017 1021 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 DAW1Q8N136 415 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 RNF169Q8NCN4 708 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CALML4Q96GE6 196 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 HIP1RO75146 1068 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 RB1P06400 928 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4BP0C869 781 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 AXLP30530 894 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CTNNB1P35222 781 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 NAMPTP43490 491 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 RAB27AP51159 221 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 GPM6BQ13491 265 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SPECC1Q5M775 1068 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 USP49Q70CQ1 688 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CPB2Q96IY4 423 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 EPSTI1Q96J88 318 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 FZD8Q9H461 694 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT5O43286 388 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SKIP12755 728 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 GUCY2CP25092 1073 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 MAPK7Q13164 816 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R5AQ15172 486 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LPPQ93052 612 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CWH43Q9H720 699 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 HCSTQ9UBK5 93 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 COL6A3P12111 3177 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PLCG1P19174 1290 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 FAM187BQ17R55 369 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LONRF3Q496Y0 759 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 HELQQ8TDG4 1101 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PPM1EQ8WY54 764 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CCDC51Q96ER9 411 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 IFT74Q96LB3 600 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PLVAPQ9BX97 442 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 STK38Q15208 465 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 ARSHQ5FYA8 562 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 NOTUMQ6P988 496 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 DEPTORQ8TB45 409 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-211ENST00000480301 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms