RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF149Q8NC42 400 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP4Q96MN2 994 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 MFSD10Q14728 455 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 IER5Q5VY09 327 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 DEPTORQ8TB45 409 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM17Q9Y577 477 aa22.93■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 LRMPQ12912 555 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.92■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.92■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.92■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 Q9Y3F1 56 aa22.92■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.91■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.91■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 K7ERI5 159 aa22.9■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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SH3BP2-204ENST00000452765 NDST4Q9H3R1 872 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.89■■□□□ 1.25
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SH3BP2-204ENST00000452765 GINS2Q9Y248 185 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PPME1Q9Y570 386 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 DNM2P50570 870 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 APBA1Q02410 837 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNA10Q16322 511 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.87■■□□□ 1.25
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