RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU1-38P-201ENST00000362817 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU1-38P-201ENST00000362817 DISC1Q9NRI5 854 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU1-38P-201ENST00000362817 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASTN1O14525 1302 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFIBO00712 420 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYTH3O43739 400 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CELA3AP09093 270 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPA1P15085 419 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOMEZQ8IX15 550 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMTC2Q8N394 836 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF214Q8ND24 703 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP3K14Q99558 947 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 TINF2Q9BSI4 451 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PFASO15067 1338 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC69A6NI79 296 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDAH1O94760 285 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOSL1P15407 271 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RXRAP19793 462 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 USH1GQ495M9 461 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNMA2Q9UL42 364 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCB11O95342 1321 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBTB5O15062 677 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEPT4O43236 478 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS6KB1P23443 525 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNGA1P29973 690 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTLL4Q14679 1199 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 APOA5Q6Q788 366 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 NSMFQ6X4W1 530 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D5Q92609 795 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 GATA6Q92908 595 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIGSQ96S52 555 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 KATNBL1Q9H079 304 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYH6P13533 1939 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SORBS3O60504 671 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSCO60682 206 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALM1P0DP23 149 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALM2P0DP24 149 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALM3P0DP25 149 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CAPN2P17655 700 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMARCA1P28370 1054 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF5BP33176 963 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADMP35318 185 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANO1Q5XXA6 986 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6ZUG5 572 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARMCX2Q7L311 632 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 MICU3Q86XE3 530 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 DTX1Q86Y01 620 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOMER1Q86YM7 354 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXL16Q8N461 479 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms