RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 POU5F1BQ06416 359 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 LGALS16A8MUM7 142 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 KRT37O76014 449 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 LCP1P13796 627 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ANP32DO95626 131 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 IMPG1Q17R60 797 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 GIPC2Q8TF65 315 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SP110Q9HB58 689 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ATP8B1O43520 1251 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SDC4P31431 198 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SIK2Q9H0K1 926 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SUN2Q9UH99 717 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 MAPK13O15264 365 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 FBXW4P57775 412 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ITM2BQ9Y287 266 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 RASA4BC9J798 803 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PODXLO00592 558 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 RASA4O43374 803 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 CPB1P15086 417 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 FAM20AQ96MK3 541 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PTCH1Q13635 1447 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 A8MXQ7 604 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 E5RI56 91 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 THEGQ9P2T0 379 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 GYS2P54840 703 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ACAD9Q9H845 621 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 STK36Q9NRP7 1315 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 DFFAO00273 331 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SFNP31947 248 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 ESRRGP62508 458 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 KIF12Q96FN5 646 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 TAF11Q15544 211 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 BARHL2Q9NY43 387 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM15Q9C019 465 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM247A6NEH6 219 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TFDP2Q14188 446 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 RNF135Q8IUD6 432 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MMEP08473 750 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PROM2Q8N271 834 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SPON2Q9BUD6 331 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ELP3Q9H9T3 547 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KCNQ2O43526 872 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SPARCL1Q14515 664 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 COPS2P61201 443 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KDM6BO15054 1643 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM49P0CI25 452 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM49CP0CI26 452 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA5P30532 468 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 PSMC5P62195 406 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 KDELC2Q7Z4H8 507 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 AKR1B1P15121 316 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 NNMTP40261 264 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 HMGCS2P54868 508 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP7Q16576 425 aa23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms