RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.33■■□□□ 1.17
RALGPS1-202ENST00000319107 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.33■■□□□ 1.17
RALGPS1-202ENST00000319107 POLD4Q9HCU8 107 aa22.33■■□□□ 1.17
RALGPS1-202ENST00000319107 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTN1P12814 892 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF131P52739 623 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 LPIN1Q14693 890 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 USP38Q8NB14 1042 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CDH23Q9H251 3354 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 NR1I2O75469 434 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM13AO94988 1023 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PLS3P13797 630 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 AFMP43652 599 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PHKA2P46019 1235 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PTENP60484 403 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 RASIP1Q5U651 963 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CNNM3Q8NE01 707 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 VWCEQ96DN2 955 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SFI1A8K8P3 1242 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PEX3P56589 373 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM228AQ86W67 206 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PAGE5Q96GU1 130 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 TIGD1Q96MW7 591 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PARVGQ9HBI0 331 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 RPS6KA5O75582 802 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 MYL1P05976 194 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ASIC1P78348 528 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ODR4Q5SWX8 454 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DEPTORQ8TB45 409 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PTPRSQ13332 1948 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBBXA8MT70 800 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CD52P31358 61 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 NPTX2P47972 431 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PAK2Q13177 524 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 KANK3Q6NY19 840 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 APBB2Q92870 758 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 KINO60870 393 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PRR29P0C7W0 189 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 IDEP14735 1019 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 GAP43P17677 238 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAJB2P25686 324 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CASP1P29466 404 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 NCKAP1LP55160 1127 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CUL4BQ13620 913 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 GRIN2CQ14957 1233 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SFR1Q86XK3 245 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 MYCT1Q8N699 235 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 SEPT8Q92599 483 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 FIZ1Q96SL8 496 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PANK4Q9NVE7 773 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 DACT1Q9NYF0 836 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PADI3Q9ULW8 664 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-202ENST00000319107 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms