RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifnb1P01575 182 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Meis3P97368 378 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Yipf3Q3UDR8 347 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asnsd1Q8BFS9 627 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam49aQ8BHZ0 323 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stap2Q8R0L1 411 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prkag2Q91WG5 566 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chmp2aQ9DB34 222 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Krt17Q9QWL7 433 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Exoc7O35250 697 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CnpP16330 420 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Uhmk1P97343 419 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PdxkQ8K183 312 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Igsf9bE9PZ19 1328 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem132bF7BAB2 1078 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vti1aO89116 217 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 S100a5P63084 93 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GmpsQ3THK7 693 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Upf3bQ3ULL6 472 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrn2Q6PHP6 730 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc7a14Q8BXR1 771 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plekhg6Q8R0J1 787 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Them5Q9CQJ0 248 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp2d34L7N463 504 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prl2c3P04768 224 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gprin1Q3UNH4 932 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Usp13Q5BKP2 858 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf12Q7TSI0 686 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NptxrQ99J85 493 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CraddO88843 199 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ece1Q4PZA2 769 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Grm4Q68EF4 912 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P3h4Q8K2B0 443 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Camta1A2A891 1682 aa18.03■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifnar1P33896 590 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SftpbP50405 377 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Thumpd3P97770 505 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pla2g4cQ64GA5 597 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zkscan3Q91VW9 553 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Osbpl9A2A8Z1 736 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc63A6H694 637 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3043K7N693 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm16440K7N6G6 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm2244L7N2A3 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3278L7N2D2 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8271L7N2E2 218 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arl4cP61208 192 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FcgrtQ61559 365 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syne4Q8CII8 388 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ulbp1Q8HWA3 334 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rexo5D3YW29 759 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpc4P51655 557 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vamp7P70280 220 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sec23aQ01405 765 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rasip1Q3U0S6 961 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kiaa1841Q68FF0 718 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam20aQ8CID3 541 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gga1Q8R0H9 635 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tgm5Q9D7I9 724 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tlr2Q9QUN7 784 aa18.02■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc6O88978 473 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Apol9bQ8C7I4 310 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Btbd7Q8CFE5 1130 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Apol9aQ8VDU3 310 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmd10Q9Z2X2 231 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Men1O88559 611 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klhl14Q69ZK5 630 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fbxo28Q8BIG4 368 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tph2Q8CGV2 488 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abcg3Q99P81 650 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Iqcf1Q9D9K8 182 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myo1eE9Q634 1107 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tal1P22091 329 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mettl17Q3U2U7 461 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Odr4Q4PJX1 447 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CgasQ8C6L5 507 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plagl2Q925T4 496 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cmtr1Q9DBC3 837 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stat2Q9WVL2 923 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mucl2P02815 138 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifnl2Q4VK74 193 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb8osQ505B7 168 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PhkbQ7TSH2 1085 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Parp10Q8CIE4 960 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms