RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109241.4

Snx18-201, Transcript of Sorting nexin-18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx18, Length 4,447 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zfp839E9PUU5 921 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm5795E9PZN8 263 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pde4aO89084 844 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trpc6Q61143 930 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Basp1Q91XV3 226 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rnf112Q96DY5 654 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cox16Q9CR63 106 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Olfr310B2RVZ1 332 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Grm4Q68EF4 912 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Prdm4Q80V63 803 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Parp10Q8CIE4 960 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 IkbipQ9DBZ1 373 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tmod4Q9JLH8 345 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 PapolbQ9WVP6 641 aa16.62■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 EsrraO08580 422 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tal1P22091 329 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mageb18Q8BQR7 327 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rfx6Q8C7R7 927 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Eps8l2Q99K30 729 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fmnl1Q9JL26 1094 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Etnk2A7MCT6 385 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Prmt9Q3U3W5 846 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Olfr805Q8VFI4 319 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc65Q8VHI7 493 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 MlphQ91V27 590 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dnajc14Q921R4 703 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 BlvraQ9CY64 295 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Serpina9Q9D7D2 418 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dnajc7Q9QYI3 494 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Clrn2B2RVW2 232 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Myl1P05977 188 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nkx2-5P42582 318 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Frmd8Q3UFK8 466 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 PapolaQ61183 739 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Q6DFW0 481 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Plagl2Q925T4 496 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cmtr1Q9DBC3 837 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rtn3Q9ES97 964 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tspyl5Q69ZB3 406 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ankrd45Q810N6 248 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tmem120aQ8C1E7 343 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 PccaQ91ZA3 724 aa16.61■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mon2Q80TL7 1715 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm1758F6VZZ1 202 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Per2O54943 1257 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 OatP29758 439 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 ItgadQ3V0T4 1168 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ifnl2Q4VK74 193 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Adck2Q6NSR3 617 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 FtoQ8BGW1 502 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim35Q8C006 501 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tasp1Q8R1G1 420 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nek8Q91ZR4 698 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim7Q923T7 510 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mss51Q9D5Z5 446 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm43302L7N1X8 611 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Lrch2Q3UMG5 773 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rnf6Q9DBU5 667 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kcna1P16388 495 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dars2Q8BIP0 653 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nmrk1Q91W63 195 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Chmp2aQ9DB34 222 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Map2P20357 1828 aa16.6■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ankmy2Q3TPE9 440 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mxd3Q80US8 206 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trappc11B2RXC1 1133 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm4307E9PZY4 289 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm4312K9J7E2 289 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arl4cP61208 192 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nsun7Q14AW5 724 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Smg5Q6ZPY2 1017 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Adrm1Q9JKV1 407 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arap3Q8R5G7 1538 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Krt36B1AQ75 473 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kif11Q6P9P6 1052 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Klhl11Q8CE33 709 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arfip2Q8K221 341 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Bbs7Q8K2G4 715 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Txndc5Q91W90 417 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mageb16Q9CWV4 363 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tspan17Q9D7W4 270 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tbx18Q9EPZ6 613 aa16.59■□□□□ 0.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rnf14Q9JI90 485 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms