RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp4f40G3UW81 524 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PrlP06879 226 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atf2P16951 487 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Syt2P46097 422 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gsdmc4Q3TR54 480 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Muc3aQ3U5A2 218 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ctnna2Q61301 953 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ssx2ipQ8VC66 615 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Plekhh3Q8VCE9 796 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ears2Q9CXJ1 523 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tfap4Q9JIZ5 338 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm43302L7N1X8 611 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Col6a1Q04857 1025 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem65Q4VAE3 234 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 C2cd2lQ80X80 706 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam163bQ8BUM6 167 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arhgef19Q8BWA8 802 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam227aQ9D3V8 625 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Phf2Q9WTU0 1096 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 GnazO70443 355 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cxcr2P35343 359 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptpn14Q62130 1189 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gimap8Q75N62 688 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Elmo3Q8BYZ7 720 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rassf9Q8K342 435 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prkag2Q91WG5 566 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ttc1Q91Z38 292 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cetn2Q9R1K9 172 aa15.64■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zbed6D2EAC2 980 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 C130060K24RikG3UWA8 416 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tspyl1O88852 379 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Shox2P70390 331 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dusp19Q8K4T5 220 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ppp2r5dQ91V89 594 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc70Q9D9B0 223 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ttc38A3KMP2 465 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fgd3O88842 733 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrfn1Q2WF71 766 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q3TTJ4 293 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Klhl23Q6GQU2 558 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q6PD19 689 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf365Q8BG89 408 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Frmd4bQ920B0 1035 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pgm3Q9CYR6 542 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 GakQ99KY4 1305 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Col16a1Q8BLX7 1580 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf711A2ANX9 761 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Chrna9G3X8Z7 479 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gna11P21278 359 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aars2Q14CH7 980 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kcna6Q61923 529 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cdk17Q8K0D0 523 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Basp1Q91XV3 226 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pls3Q99K51 630 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gpatch1Q9DBM1 930 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MesdQ9ERE7 224 aa15.63■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 DtnbO70585 659 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sash1P59808 1230 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim43bP86448 445 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Togaram2Q3TYG6 1002 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SlmapQ3URD3 845 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Syne3Q4FZC9 975 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sept9Q80UG5 583 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mageb18Q8BQR7 327 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcdha10Q91Y20 946 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nt5c1bQ91YE9 573 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cmtr1Q9DBC3 837 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Itpripl1A2ASA8 547 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm1141B9EJU1 475 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Msh3P13705 1091 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SftpbP50405 377 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rgs9bpQ148R9 237 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf879Q8BI99 563 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AuhQ9JLZ3 314 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Stat3P42227 770 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Eps15P42567 897 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ndufaf2Q59J78 168 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cd37Q61470 281 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zdhhc24Q6IR37 284 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gramd1bQ80TI0 738 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 NelfcdQ922L6 591 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Smyd3Q9CWR2 428 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ifrd2Q9D8U0 441 aa15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q9DA42 136 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms