RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnj6P48542 425 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm6P97311 821 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prss36Q5K2P8 849 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcf12Q61286 706 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhb14Q6PB90 796 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GmipQ6PGG2 971 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1046Q7TR79 316 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clec1aQ8BWY2 269 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kctd12bQ8C7J6 292 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc28Q8VCE1 385 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bbox1Q924Y0 387 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kremen1Q99N43 473 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plxna1P70206 1894 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arf4P61750 180 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrkcbP68404 671 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctnna3Q65CL1 895 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrgprb8Q7TN51 330 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc39bQ8BYY4 617 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnai1Q8C0M8 701 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spock2Q9ER58 423 aa25.06■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EgfP01132 1217 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp11b2P15539 500 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tal1P22091 329 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ArvcfP98203 962 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ap5z1Q3U829 807 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl2c1Q5SVL9 228 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc26a2Q62273 739 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msantd2Q6NZR2 559 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ftsj1Q8CBC7 324 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb36Q8K3U4 67 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Washc1Q8VDD8 475 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acot11Q8VHQ9 594 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pls3Q99K51 630 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sgpp1Q9JI99 430 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MtrA6H5Y3 1253 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgfr4Q03142 799 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Edem3Q2HXL6 931 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Upf3aQ3ULJ3 422 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp28Q5I043 1051 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nrip1Q8CBD1 1161 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1352Q8VGX5 309 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v0a4Q920R6 833 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olr1Q9EQ09 363 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B4galt5Q9JMK0 388 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hebp1Q9R257 190 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col4a6B1AVK5 1691 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pex10B1AUE5 324 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trappc11B2RXC1 1133 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01734 135 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EpoP07321 192 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Susd6Q8BGE4 302 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pak2Q8CIN4 524 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VillQ91YD6 859 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Necab2Q91ZP9 389 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pstpip2Q99M15 334 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramef12Q9D2F1 463 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spatc1lQ9D9W0 342 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl11aQ9QYE3 773 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CluhQ5SW19 1315 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4907B1AXB9 411 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gimd1E9PW74 217 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ca3P16015 260 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smpd1Q04519 627 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf473Q8BI67 892 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem260Q8BMD6 703 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnq4Q9JK97 696 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncor1Q60974 2453 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13084A2A8N0 494 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mdm4O35618 489 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msh3P13705 1091 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mark3Q03141 753 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcar1Q61140 874 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Enox2Q8R0Z2 598 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ushbp1Q8R370 680 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mob2Q8VI63 235 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Egfl7Q9QXT5 275 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Peg12Q9WVA7 283 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Htatip2Q9Z2G9 242 aa25.01■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdr2lA2A6T1 465 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp472B0V2W5 534 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ace3D0G895 737 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina16D3Z660 418 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtproE9Q612 1226 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AurkbO70126 345 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P4hbP09103 509 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms