RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA AGA2P32781 87 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ZRT3P34240 503 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SLM1P40485 686 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA INA22P40576 216 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA FMP48P53233 369 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YMR244WQ04018 355 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA UBX2Q04228 584 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA BI3Q9ZZW7 517 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CPT1P17898 393 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA IME2P32581 645 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YMR262WP38430 313 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA STE23Q06010 1027 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA TRM10Q12400 293 aa2.13□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SPS100P13130 326 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA PET18P25362 215 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YHR035WP38769 630 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA DSE1P40077 573 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YFL040WP43562 540 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA IRC4Q03036 179 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA MIM1Q08176 113 aa2.12□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RPB9P27999 122 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YPS1P32329 569 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SSO2P39926 295 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YIL059CP40520 121 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YGL118CP53132 145 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA VPS20Q04272 221 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RFM1Q12192 310 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA TFC7Q12415 435 aa2.11□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ERD1P16151 362 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA INO2P26798 304 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SPO73P40031 143 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CAX4P53223 239 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA OKP1P53298 406 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YNR066CP53752 436 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA VIK1Q12045 647 aa2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA VPH2P32341 215 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ZRT1P32804 376 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA PET8P38921 284 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA AIM20P40451 204 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ASG7P46993 209 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RPN14P53196 417 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CAB5Q03941 241 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SNX41Q04053 625 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YLR297WQ05899 129 aa2.09□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA CSE1P33307 960 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YKL162CP36052 402 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SWC5P38326 303 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA END3P39013 349 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YPL080CQ02826 108 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA ERP3Q12403 225 aa2.09□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA IFM1P25038 676 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA MCH2P36032 473 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YDR089WP38966 869 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA PES4P39684 611 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA CSI1Q04368 295 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YPL264CQ08980 353 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YPR1Q12458 312 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA LAG2Q92325 660 aa2.08□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.07□□□□□ -2.08not detected
15S_rRNA15S_rRNA GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA HPR1P17629 752 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SUR1P33300 382 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA AIM29P36154 155 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA LOH1P47055 219 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YOR292CQ08743 309 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA REX3Q12090 404 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA IZH4Q99393 312 aa2.07□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA MED8P38304 223 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA ECM14P38836 430 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA LIF1P53150 421 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA SWC4P53201 476 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA YLR446WQ06204 433 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA STF1P01098 86 aa2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA RPL5P26321 297 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA ARO4P32449 370 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
15S_rRNA15S_rRNA GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
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