RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	FAA2	P39518	744 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YJL193W	P39542	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SOK1	P40317	901 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	ICE2	P40499	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YJL118W	P47022	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	AIM22	P47051	409 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	COX16	P47081	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YGL159W	P53110	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YGL108C	P53139	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PEX12	Q04370	399 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	COX20	Q04935	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PAM18	Q07914	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RLM1	Q12224	676 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SNF5	P18480	905 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	GIT1	P25346	518 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
VMA13	YPR036W	TIP20	P33891	701 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	IML3	P38265	245 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	VHS2	P40463	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	GAB1	P41733	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	AGP3	P43548	558 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	TNA1	P53322	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	STP3	Q05937	343 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	CRT10	Q08226	957 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MSH5	Q12175	901 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YLR108C	Q12259	485 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PST1	Q12355	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MHT1	Q12525	324 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	COR1	P07256	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	REV1	P12689	985 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YSR3	P23501	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	VPH2	P32341	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SRB5	P32585	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	COX13	P32799	129 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	CPR5	P35176	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	NNK1	P36003	928 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YBR241C	P38142	488 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	FIG1	P38224	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	AME1	P38313	324 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SAF1	P38352	637 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PCL5	P38794	229 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RPH1	P39956	796 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YEL020C	P39994	560 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	CIN5	P40917	295 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MEP2	P41948	499 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YAR1	P46683	200 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YGL117W	P53133	265 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YGR045C	P53229	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MRPL50	P53724	139 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SDH1	Q00711	640 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SPR6	Q01684	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SPO77	Q06134	477 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	DCS1	Q06151	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	VMA16	P23968	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	PRE4	P30657	266 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YPS1	P32329	569 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	SSO1	P32867	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	BMT2	P38278	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YBR285W	P38354	144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	ALP1	P38971	573 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	ERV46	P39727	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	AYR1	P40471	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	APS3	P47064	194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YGR042W	P53227	271 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MPS1	P54199	764 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	CTF19	Q02732	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YDR541C	Q03049	344 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MMT1	Q03218	510 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	GPI11	Q06636	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YFT2	Q06676	274 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	NSE1	Q07913	336 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VMA13	YPR036W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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