RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W SPG5P42933 373 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ASG7P46993 209 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W HOC1P47124 396 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W NIF3P53081 288 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PUS2P53167 370 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YPR003CP53394 754 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W GIP3Q03016 1276 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W MHR1Q06630 226 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W TAF10Q12030 206 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YOR114WQ12219 294 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YOP1Q12402 180 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W RMD5Q12508 421 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.74□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W MET5P47169 1442 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W URA6P15700 204 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PET9P18239 318 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W RPO26P20435 155 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W CNB1P25296 175 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W UBC8P28263 218 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W DCG1P32460 244 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SRB5P32585 307 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W EFM1P38732 585 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W AIM2P39721 246 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SNG1P46950 547 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YGR017WP53210 297 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W COS6P53344 381 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ASI2P53895 289 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W COG5P53951 403 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W NUP49Q02199 472 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ABF2Q02486 183 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W OST6Q03723 332 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YMR253CQ04835 414 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W FAR10Q06001 478 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SIA1Q12212 622 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YOR214CQ12282 236 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W NCA2Q12374 616 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ZPS1Q12512 249 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.73□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SPS4P09937 338 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SLY1P22213 666 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SEC22P22214 214 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W IFM1P25038 676 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W EHD3P28817 500 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W OCH1P31755 480 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PHA2P32452 334 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SGE1P33335 543 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W FLO10P36170 1169 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W BNA4P38169 460 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W GOS1P38736 223 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YHR122WP38829 231 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.72□□□□□ -1.81not detected
YPT53YNL093W OXA1P39952 402 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W BMT5P40493 336 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W FMP32P43557 207 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W TRS85P46944 698 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W TAX4P47030 604 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W GPI14P47088 403 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YGR168CP53293 376 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YPL113CQ02961 396 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W NRG1Q03125 231 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W NHP10Q03435 203 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SIZ1Q04195 904 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W SDH7Q04401 133 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W DPP1Q05521 289 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W TPO3Q06451 622 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W THI21Q08975 551 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W AIM41Q12032 185 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W YLL058WQ12198 575 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W JLP1Q12358 412 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W ERP3Q12403 225 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W POM34Q12445 299 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W MRX4Q12467 430 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W PSF1Q12488 208 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W RGS2Q99188 309 aa3.72□□□□□ -1.81
YPT53YNL093W HIS1P00498 297 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MET2P08465 486 aa3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W IME1P21190 360 aa3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W GAC1P28006 793 aa3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W YEF1P32622 495 aa3.71□□□□□ -1.82
YPT53YNL093W MTC7P32633 139 aa3.71□□□□□ -1.82
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