RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	DFG10	P40526	253 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YCH1	P42937	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ALE1	Q08548	619 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MCT1	Q12283	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	STE7	P06784	515 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CDC50	P25656	391 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LDS1	P31379	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	DEP1	P31385	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YOX1	P34161	385 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YFR018C	P43599	363 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	VAC7	P53950	1165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CUR1	Q06469	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MHR1	Q06630	226 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	SLM3	Q12093	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	REV1	P12689	985 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YPS1	P32329	569 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	COT1	P32798	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	IML3	P38265	245 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	SWC5	P38326	303 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MMS21	P38632	267 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	PEX18	P38855	283 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	END3	P39013	349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TAF6	P53040	516 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TRM82	Q03774	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CAB5	Q03941	241 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	FSH2	Q05015	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ATP16	Q12165	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ARG80	P07249	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	PRB1	P09232	635 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LDB16	P25587	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MSN4	P33749	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TPO5	P36029	618 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CAB3	P36076	571 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MRPL37	P36532	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YLR152C	P54072	576 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LIP2	Q06005	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	FRE8	Q12209	686 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	LDB17	Q12342	491 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	ZRC1	P20107	442 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	RBK1	P25332	333 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	ACB1	P31787	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
YLL017W	YLL017W	RCK2	P38623	610 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	TIM17	P39515	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	INA22	P40576	216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	YNL320W	P42840	284 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	YNL050C	P53952	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	BUR2	Q05949	395 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	UFD4	P33202	1483 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	KRE6	P32486	720 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	PFS1	P38872	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	HEM14	P40012	539 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	YGR168C	P53293	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	CSI1	Q04368	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	GAS2	Q06135	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	PMT2	P31382	759 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	YKL070W	P36087	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	MOB2	P43563	287 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	AIM23	P47015	356 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	LOH1	P47055	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	VHT1	P53241	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	GIM3	P53900	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	SUR7	P54003	302 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	RPN6	Q12377	434 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL017W	YLL017W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 6.2 ms