RNA–Protein interactions for RNA: YJL029C

VPS53, Transcript of Component of the GARP (Golgi-associated retrograde protein) complex, yeast

Gene VPS53, Length 2,469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS53	YJL029C	SAC7	P17121	654 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PEX3	P28795	441 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SNC1	P31109	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YKL107W	P34251	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	LHS1	P36016	881 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	TAT1	P38085	619 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SIC1	P38634	284 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YHL037C	P38733	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	TRM5	P38793	499 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SIT1	P39980	628 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	IES5	P40060	125 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PRY1	P47032	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	GPI1	P53306	609 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MTQ1	P53944	314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	EKI1	Q03764	534 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SPC19	Q03954	165 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PEX12	Q04370	399 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SPC2	Q04969	178 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	GPI11	Q06636	219 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	IRC19	Q07843	230 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ULA1	Q12059	462 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RLM1	Q12224	676 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PSY3	Q12318	242 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MHF1	Q3E835	90 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	NUP1	P20676	1076 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ITR2	P30606	609 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	HIR2	P32480	875 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MAL32	P38158	584 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MLH1	P38920	769 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SEN34	P39707	275 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RBG1	P39729	369 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MPM1	P40364	252 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	COS6	P53344	381 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PET191	Q02772	108 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	GIS1	Q03833	894 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ARV1	Q06541	321 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	NDL1	Q06568	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SWM1	Q12379	170 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	DFG16	Q99234	619 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PCL2	P25693	308 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	NIC96	P34077	839 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YKL077W	P36081	392 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YKL071W	P36086	256 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YBR096W	P38256	230 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SKN7	P38889	622 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MAM33	P40513	266 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RSN1	Q03516	953 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	RNH202	Q05635	350 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
VPS53	YJL029C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	JEN1	P36035	616 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YHR180W	P38868	163 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	LAS21	P40367	830 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	AVT7	P40501	490 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	CHA4	P43634	648 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	YGR168C	P53293	376 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	INP1	Q03694	420 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ACL4	Q03771	387 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	SNX41	Q04053	625 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	CRR1	Q05790	422 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	DCI1	Q08558	271 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	HER1	Q12276	1246 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	HEM4	P06174	275 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PRB1	P09232	635 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	PMR1	P13586	950 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ERD2	P18414	219 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	MAK32	P23060	363 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	APD1	P38281	316 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	TDP1	P38319	544 aa		3.17	□□□□□ -1.9
VPS53	YJL029C	ZRG8	P40021	1076 aa		3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 106.1 ms