RNA–Protein interactions for RNA: YGR003W

CUL3, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene CUL3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CUL3	YGR003W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SPO24	Q3E752	67 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CIN8	P27895	1000 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SIF2	P38262	535 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RCK1	P38622	512 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PET8	P38921	284 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DSE1	P40077	573 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	NAS2	P40555	220 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DIA1	P54005	336 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	APC5	Q08683	685 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	REP1	P03871	373 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CPT1	P17898	393 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CDC42	P19073	191 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DAD2	P36162	133 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PEX32	P38292	413 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	MMS21	P38632	267 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YIL059C	P40520	121 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	FMP48	P53233	369 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ARR1	Q06596	294 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PSY3	Q12318	242 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	URA10	P30402	227 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PEX5	P35056	612 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	MYO3	P36006	1272 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SDH4	P37298	181 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ALP1	P38971	573 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YNL320W	P42840	284 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	NRM1	P53718	249 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ZIP1	P31111	875 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YBR062C	P38239	180 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PMT4	P46971	762 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	GLE1	Q12315	538 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	APC2	Q12440	853 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	VPS63	O13549	108 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CUP2	P15315	225 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DAL81	P21657	970 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	ERG9	P29704	444 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	HMX1	P32339	317 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YER084W	P40057	128 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YFL040W	P43562	540 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YJL144W	P47009	104 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	EOS1	P53938	366 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	AQR1	P53943	586 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	STE23	Q06010	1027 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SPH1	Q06160	661 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	MHP1	P43638	1398 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CTA1	P15202	515 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DAL5	P15365	543 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	CKA2	P19454	339 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YCR025C	P25352	136 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YKL071W	P36086	256 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YBL028C	P38202	106 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YMR134W	P40207	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YIR035C	P40579	254 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	SDS23	P53172	527 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	APC4	Q04601	652 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DXO1	Q06349	442 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PCH2	P38126	564 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	APE4	P38821	490 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CUL3	YGR003W	YLL053C	P0CD98	152 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	GPX1	P36014	167 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	EFM1	P38732	585 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	GMC1	Q04399	608 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	DCC1	P25559	380 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	BUD2	P33314	1104 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	YKL162C	P36052	402 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	ASG7	P46993	209 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	CAX4	P53223	239 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CUL3	YGR003W	YNR066C	P53752	436 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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