RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	YGL235W	P53071	178 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YNL140C	P53910	189 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	CSM4	Q08955	156 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	JLP1	Q12358	412 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RKM5	Q12367	367 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	LAS17	Q12446	633 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	PET20	Q99373	253 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	TOA2	P32774	122 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	LST4	P34239	828 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	DRE2	P36152	348 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MRX3	P38172	270 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	APD1	P38281	316 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RCK2	P38623	610 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	VMA22	P38784	181 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	BMT5	P40493	336 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YFL015C	P43578	164 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YJR154W	P47181	346 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	TIS11	P47977	285 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SBH2	P52871	88 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MGA1	P53050	456 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YGR042W	P53227	271 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	LST7	P53237	242 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	CAF40	P53829	373 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	CDC14	Q00684	551 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MSS11	Q03825	758 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	VBA1	Q04301	562 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RAD34	Q06665	692 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MCH4	Q08268	501 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MUM3	Q08750	479 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SUC2	P00724	532 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.66	□□□□□ -1.82	not detected
SLX8	YER116C	POF1	P25576	258 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YCR102C	P25608	368 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	EHD3	P28817	500 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MKK1	P32490	508 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	CSE1	P33307	960 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	HMT1	P38074	348 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YAP3	P38749	330 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	MET30	P39014	640 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RBG1	P39729	369 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YIA6	P40556	373 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SFH5	P47008	294 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YGL204C	P53089	101 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ALG13	P53178	202 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	GTR2	P53290	341 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	GND2	P53319	492 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	IBD2	P53892	351 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YNL095C	P53932	642 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YLR460C	P54007	376 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	IRC4	Q03036	179 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SNO1	Q03144	224 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	CTR3	Q06686	241 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	YET3	Q07451	203 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CBS2	P14905	389 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	HEM15	P16622	393 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CTS1	P29029	562 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	ITR2	P30606	609 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	YKL063C	P35725	167 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	MCH2	P36032	473 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	RIB5	P38145	238 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	ECM8	P38246	354 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	DER1	P38307	211 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CUE1	P38428	203 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	LAG1	P38703	411 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.83	RIP-Chip
SLX8	YER116C	YAT2	P40017	923 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CDC1	P40986	491 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	YCH1	P42937	148 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	CIN2	P46670	268 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	YJR079W	P47126	109 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	YGL117W	P53133	265 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	SLD5	Q03406	294 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	SPC24	Q04477	213 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX8	YER116C	ENB1	Q08299	606 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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