RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 PRP18P33411 251 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 AAD14P42884 376 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PKP2P53170 491 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SAM50P53969 484 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RHO4Q00246 291 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PST1Q12355 444 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 Q0142Q9ZZW4 58 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YCL002CP25565 263 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YCR102CP25608 368 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MRP20P32387 263 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SEF1P34228 1148 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ALY1P36117 915 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 AIM29P36154 155 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 IKI1P38874 309 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 VPS73P53142 486 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 TMA10Q06177 86 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 FYV7Q12247 151 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PNO1Q99216 274 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SCH9P11792 824 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 MTC2P34246 357 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 THI80P35202 319 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 GAT1P43574 510 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 TAF4P50105 388 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 MHT1Q12525 324 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data9.02□□□□□ -0.97not detected
RDN25-2RDN25-2 PGD1P40356 397 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 CIN5P40917 295 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ATG18P43601 500 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ALK1P43633 760 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 TDA1Q03533 586 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 RRP45Q05636 305 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 MRI1Q06489 411 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 MMP1Q12372 583 aa9.02□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 RRP3P38712 501 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 UIP3P39547 235 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SDO1Q07953 250 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 Q0010Q9ZZX9 128 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 AI3P03877 415 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 DEG1P31115 442 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 AZF1P41696 914 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ATF2P53296 535 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 EAR1Q03212 550 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YPR084WQ06821 456 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ARG80P07249 177 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 DSS4P32601 143 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SPO73P40031 143 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PKP1P40530 394 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YPR011CQ12251 326 aa9.01□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SST2P11972 698 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 IRS4P36115 615 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 GMH1P36125 273 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NAM8Q00539 523 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ODC1Q03028 310 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PEX11Q12462 236 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SSA3P09435 649 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NAM2P11325 894 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 ARF2P19146 181 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 FMP23P38231 175 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 STD1Q02794 444 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 HDA2Q06629 674 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 IRC10Q08118 586 aa9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NBA1Q08229 501 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 RFA1P22336 621 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YCP4P25349 247 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SSH1P38353 490 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 BAP3P41815 604 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 UFD1P53044 361 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SYF2P53277 215 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 DCI1Q08558 271 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 AKR2Q12013 749 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SIA1Q12212 622 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 CYC1P00044 109 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 FUR4P05316 633 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PEP4P07267 405 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NAR1P23503 491 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data8.99□□□□□ -0.97not detected
RDN25-2RDN25-2 HMT1P38074 348 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YJR107WP47145 328 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 NDD1Q08887 554 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 MTF1P14908 341 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SEC62P21825 274 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 TIM23P32897 222 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 TSL1P38427 1098 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 VAC8P39968 578 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PAM16P42949 149 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PRM1P53835 661 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YPL067CQ02754 198 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 GRC3Q07845 632 aa8.99□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 AHC2P25649 128 aa8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 CBP4P37267 147 aa8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YNL140CP53910 189 aa8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 SMA2Q04658 369 aa8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 PML1Q07930 204 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RDN25-2RDN25-2 YBL029C-AQ3E756 94 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 157.2 ms