RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM32Q13049 653 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R5AQ15172 486 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 VSTM4Q8IW00 320 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP11Q8WWU5 503 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ERO1AQ96HE7 468 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX20Q9UMR3 447 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND3A2RUS2 1198 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YCG3 227 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 N4BP3O15049 544 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX33O43247 280 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 FKTNO75072 461 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GNA14O95837 355 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 NR3C1P04150 777 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL13P26373 211 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 MARSP56192 900 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 DRP2Q13474 957 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 HS2ST1Q7LGA3 356 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCP3Q8IZU3 236 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA5Q8TBA6 731 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 CLIC2O15247 247 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 C22orf31O95567 290 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 F2P00734 622 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 SCP2P22307 547 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCD1P33897 745 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 SUGCTQ9HAC7 445 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT4O43236 478 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ELNP15502 786 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 HS1BP3Q53T59 392 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC6Q7Z403 805 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM174Q8WUU8 243 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 KAT2BQ92831 832 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPACTQ9P2X3 320 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PBX1P40424 430 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 DMAC2Q9NW81 257 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS16A8MUM7 142 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB2O15479 319 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY3O60266 1144 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 GJA9P57773 515 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 IGBP1P78318 339 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 BEX3Q00994 111 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPSQ13938 189 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBPC2Q14324 1141 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS1R3Q7RTX0 852 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A9Q8IVB4 645 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf56Q8IXR9 622 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 RETREG2Q8NC44 543 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SIP14410 1827 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 TPM2P07951 284 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 KLRC1P26715 233 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PPFIA1Q13136 1202 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN2A1Q16706 1144 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN21Q16825 1174 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 HAS3O00219 553 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGCRP04035 888 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 CNGA1P29973 690 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX3-2P78367 333 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF6Q15052 776 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIK4Q16099 956 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD5Q7Z6J6 570 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 DEPTORQ8TB45 409 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP3O75969 853 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL3P08590 195 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 DNM2P50570 870 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA3BQ502W6 1294 aa27.29■■□□□ 1.96
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