RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 EFCAB14O75071 495 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CYP11B2P19099 503 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 IKBKEQ14164 716 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TCTN1Q2MV58 587 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 USP49Q70CQ1 688 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 HPSEQ9Y251 543 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ZBBXA8MT70 800 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ASAP2O43150 1006 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PLCG1P19174 1290 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CD52P31358 61 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PAK2Q13177 524 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 NLRP4Q96MN2 994 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 MYH11P35749 1972 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RPS6KA5O75582 802 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ARL2P36404 184 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SYKP43405 635 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ODR4Q5SWX8 454 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 KSR1Q8IVT5 923 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PADI3Q9ULW8 664 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PTPRSQ13332 1948 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 A0A087WZ62 844 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 CAMK4Q16566 473 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GPR182O15218 404 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF202O95125 648 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PLA2G4BP0C869 781 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SLC12A3P55017 1021 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 FAM228AQ86W67 206 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 TIGD1Q96MW7 591 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 KCNJ6P48051 423 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC15Q8TF66 581 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 KCND2Q9NZV8 630 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 STK17AQ9UEE5 414 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GLRA2P23416 452 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 POU5F1BQ06416 359 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 TFDP1Q14186 410 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RNF149Q8NC42 400 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RAD54LQ92698 747 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SLC9A7Q96T83 725 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 TTC3P53804 2025 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GBF1Q92538 1859 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 CAPSQ13938 189 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 KIFAP3Q92845 792 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 TIPINQ9BVW5 301 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 GUCY2CP25092 1073 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PHKA2P46019 1235 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 TMX1Q9H3N1 280 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4D-208ENST00000588667 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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