RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617		H0Y626	953 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM16	O95361	564 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	KLRC2	P26717	231 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	BCAR1	P56945	870 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	POTEH	Q6S545	545 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	LRBA	P50851	2863 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617		B8ZZF3	427 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CAPN9	O14815	690 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC28A2	O43868	658 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PAPLN	O95428	1278 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CAVIN2	O95810	425 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM189B	P81408	668 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CREB5	Q02930	508 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PLK5	Q496M5	336 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PI4KA	P42356	2102 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPRC	P08575	1304 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617		B4DLN1	442 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MTX1	Q13505	466 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	C2CD2L	O14523	706 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IRX4	P78413	519 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FGF13	Q92913	245 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NF1	P21359	2839 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	B4GALT3	O60512	393 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NR3C2	P08235	984 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PTGDR	Q13258	359 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	GIT2	Q14161	759 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	GRIK4	Q16099	956 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DCLK1	O15075	740 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FSHR	P23945	695 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXA6	P31267	233 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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