RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RAD54L	Q92698	747 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CUTA	O60888	179 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	UPP2	O95045	317 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	MYOG	P15173	224 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PFKFB1	P16118	471 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	NDUFA8	P51970	172 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RABGGTB	P53611	331 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	MAPK7	Q13164	816 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76	9e-7	■■□□□ 13
MLH1-222	ENST00000539477	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	B4GALT5	O43286	388 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CYP11B2	P19099	503 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TXLNA	P40222	546 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PBX2	P40425	430 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RFC5	P40937	340 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RESP18	Q5W5W9	173 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	AFM	P43652	599 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	DNM2	P50570	870 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PEX3	P56589	373 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PAK2	Q13177	524 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	E2F4	Q16254	413 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	FSIP1	Q8NA03	581 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	MYMK	A6NI61	221 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	FGB	P02675	491 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CXCL10	P02778	98 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ARL2	P36404	184 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	GATM	P50440	423 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	ADAL	Q6DHV7	355 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	DDX12P	Q92771	950 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MLH1-222	ENST00000539477	SLC16A4	O15374	487 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	IDE	P14735	1019 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ANK1	P16157	1881 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	NPTX2	P47972	431 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.26	□□□□□ -0.77

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