RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 PDCP20941 246 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 RAB34Q9BZG1 259 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 CHST12Q9NRB3 414 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 STK24Q9Y6E0 443 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 EYSQ5T1H1 3165 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 BRAPQ7Z569 592 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 H3BNC9 293 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 ARL2P36404 184 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 BMPR1AP36894 532 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 GATMP50440 423 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 ECM1Q16610 540 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 RNF149Q8NC42 400 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 PPM1EQ8WY54 764 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 DACT1Q9NYF0 836 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 A0A0U1RQF3 1178 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 RB1P06400 928 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 POU5F1BQ06416 359 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 SYT1P21579 422 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CTNNB1P35222 781 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 RNF19AQ9NV58 838 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PP2D1A8MPX8 630 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 FGFR1P11362 822 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 GLRA2P23416 452 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PHKA2P46019 1235 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PTENP60484 403 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 GPM6BQ13491 265 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CAPSQ13938 189 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 TFDP1Q14186 410 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 EOMESO95936 686 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 KRT79Q5XKE5 535 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PADI6Q6TGC4 694 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PLVAPQ9BX97 442 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 HOXA2O43364 376 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CYP11B2P19099 503 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CDC25AP30304 524 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 P2RX5Q93086 422 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CASD1Q96PB1 797 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF623O75123 536 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 BMP15O95972 392 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 SKIP12755 728 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 RESTQ13127 1097 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 PTPROQ16827 1216 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM200B-218ENST00000512855 HYIQ5T013 277 aa25.21■■□□□ 1.63
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