RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	GJC1	P36383	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PRPH	P41219	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MORC3	Q14149	939 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SLITRK3	O94933	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SYN1	P17600	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CD58	P19256	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KRT9	P35527	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	HSD17B4	P51659	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GRB10	Q13322	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SPA17	Q15506	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	COL4A5	P29400	1685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NEFH	P12036	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FANCC	Q00597	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPA	Q15257	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIB2	Q92519	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	HAS1	Q92839	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	P2RX5	Q93086	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	4e-11	■□□□□ 8.6
TRA2B-215	ENST00000492417	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SEPT4	O43236	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MSC	O60682	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ARIH2	O95376	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CCL5	P13501	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PRCP	P42785	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TERF1	P54274	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	STK4	Q13043	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PAK2	Q13177	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417		Q4G0T1	1027 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	CLGN	O14967	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	EVI5	O60447	810 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	LRRN2	O75325	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	GCLM	P48507	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	UGCG	Q16739	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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