RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 FOSBP53539 338 aa24.18■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.18■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 FAM20AQ96MK3 541 aa24.18■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 NLRP4Q96MN2 994 aa24.18■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 RGL1Q9NZL6 768 aa24.15■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 TNFRSF25Q93038 417 aa24.13■■□□□ 1.45
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USP40-215ENST00000484528 CHST12Q9NRB3 414 aa24.13■■□□□ 1.45
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USP40-215ENST00000484528 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.12■■□□□ 1.45
USP40-215ENST00000484528 COASYQ13057 564 aa24.12■■□□□ 1.45
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USP40-215ENST00000484528 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.11■■□□□ 1.45
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USP40-215ENST00000484528 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
USP40-215ENST00000484528 SEC24BO95487 1268 aa24.1■■□□□ 1.45
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