RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 TGFB1I1O43294 461 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 C22orf31O95567 290 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 F2P00734 622 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 GJA9P57773 515 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 PPFIA1Q13136 1202 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 GRIK4Q16099 956 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 KIFAP3Q92845 792 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 STRA6Q9BX79 667 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTS4O75173 837 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R37O75864 691 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 FANCCQ00597 558 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 MFSD10Q14728 455 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 ZCWPW2Q504Y3 356 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 RHPN2Q8IUC4 686 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 DENND3A2RUS2 1198 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 RFC5P40937 340 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 CDKAL1Q5VV42 579 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 TAS1R3Q7RTX0 852 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 SEL1LQ9UBV2 794 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 Q9Y3F1 56 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 VTNP04004 478 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 PSEN2P49810 448 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 NCKAP1LP55160 1127 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 CAPSQ13938 189 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 KCNA10Q16322 511 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SERPINC1P01008 464 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 GNRH1P01148 92 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 EDN1P05305 212 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SPC24Q8NBT2 197 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TIPINQ9BVW5 301 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 MTFR1Q15390 333 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 IFT74Q96LB3 600 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 PCIF1Q9H4Z3 704 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TAB2Q9NYJ8 693 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 HDAC6Q9UBN7 1215 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 BICDL2A1A5D9 508 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 KCNJ18B7U540 433 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 ASGR1P07306 291 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF75DP51815 510 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 KCNJ12Q14500 433 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 BMT2Q1RMZ1 405 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 NLRP4Q96MN2 994 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 VPS16Q9H269 839 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 INTS13Q9NVM9 706 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 PTPN22Q9Y2R2 807 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD63C9JTQ0 380 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TREHO43280 583 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 MAPTP10636 758 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 CASP4P49662 377 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SMTNP53814 917 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TPM4P67936 248 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 GTF2BQ00403 316 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 RNF149Q8NC42 400 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 SLAIN1Q8ND83 568 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TBX20Q9UMR3 447 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 KAT6AQ92794 2004 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 HAS3O00219 553 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TEX33O43247 280 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 ADAM9Q13443 819 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 KRT31Q15323 416 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 TCP11X2Q5H9J9 407 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 LHX8Q68G74 356 aa19.86■□□□□ 0.77
ATG4B-217ENST00000475693 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms