RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 MARK3P27448 753 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CDC27P30260 824 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CCND2P30279 289 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NTRK3Q16288 839 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GPR152Q8TDT2 470 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 EPC1Q9H2F5 836 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.45□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 STK36Q9NRP7 1315 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GJB2P29033 226 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 IGBP1P78318 339 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SHC2P98077 582 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 LPAL2Q16609 132 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 RTN1Q16799 776 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 IER5Q5VY09 327 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PNMA1Q8ND90 353 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PJA1Q8NG27 643 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 MAP3K14Q99558 947 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 KAT14Q9H8E8 782 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ITPR1Q14643 2758 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 C9IYK1 514 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 DTNBO60941 627 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CALM1P0DP23 149 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CALM2P0DP24 149 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CALM3P0DP25 149 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 KRT17Q04695 432 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 FUT2Q10981 343 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NEDD9Q14511 834 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GRM4Q14833 912 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 BORCS6Q96GS4 357 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ADAM2Q99965 735 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 RGS18Q9NS28 235 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 RNF19AQ9NV58 838 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 LHX6Q9UPM6 363 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 AKAP13Q12802 2813 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TBC1D4O60343 1298 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GDF9O60383 454 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SRFP11831 508 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 IFNAR1P17181 557 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PKP1Q13835 747 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 14.8
ATG4B-211ENST00000429899 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GPR149Q86SP6 731 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 FANCBQ8NB91 859 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CASD1Q96PB1 797 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 SPG21Q9NZD8 308 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CDKL5O76039 1030 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-211ENST00000429899 CXCL14O95715 111 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms